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¿Si quitamos el "=" en la condición y también el "-1" en len(words)? Es menos código y resulta igual cierto..
max_index = len(words) while counter < max_index:
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Sí, tiene un efecto similar según entiendo con lo que estás mostrando. Es otra forma de expresarlo, la otra (a la que te refieres) debería ser
max_index = len(words - 1)
while counter <= max_index: